Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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