Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenplQ3U3S3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenplQ3U3S3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms