Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud5Q3U2S4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Otud5Q3U2S4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms