Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vars2Q3U2A8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vars2Q3U2A8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms