Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D0

Lins1, Protein Lines homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lins1Q3U1D0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lins1Q3U1D0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lins1Q3U1D0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms