Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms