Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc9Q3U0M1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms