Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd33bQ3U0L2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd33bQ3U0L2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms