Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hace1Q3U0D9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms