Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmtk2Q3TYD6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmtk2Q3TYD6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmtk2Q3TYD6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmtk2Q3TYD6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmtk2Q3TYD6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmtk2Q3TYD6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Lmtk2Q3TYD6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmtk2Q3TYD6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms