Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ccdc136Q3TVA9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms