Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D17Wsu92eQ3TT38 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
D17Wsu92eQ3TT38 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
D17Wsu92eQ3TT38 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
D17Wsu92eQ3TT38 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
D17Wsu92eQ3TT38 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
D17Wsu92eQ3TT38 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms