Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms