Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fubp3Q3TIX6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms