Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde12Q3TIU4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde12Q3TIU4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde12Q3TIU4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde12Q3TIU4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde12Q3TIU4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde12Q3TIU4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde12Q3TIU4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde12Q3TIU4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde12Q3TIU4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms