Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TEI4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TEI4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms