Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem104Q3TB48 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms