Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hddc2Q3SXD3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms