Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms