Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb33Q30KN3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb33Q30KN3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms