Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col24a1Q30D77 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col24a1Q30D77 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col24a1Q30D77 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms