Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Psd3Q2PFD7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Psd3Q2PFD7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms