Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
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Shroom4Q1W617 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
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Shroom4Q1W617 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
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Shroom4Q1W617 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
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Shroom4Q1W617 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
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Shroom4Q1W617 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
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Shroom4Q1W617 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Shroom4Q1W617 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
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Shroom4Q1W617 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
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Shroom4Q1W617 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Shroom4Q1W617 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
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Shroom4Q1W617 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Shroom4Q1W617 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Shroom4Q1W617 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms