Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd11Q1RNF8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd11Q1RNF8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd11Q1RNF8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd11Q1RNF8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd11Q1RNF8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd11Q1RNF8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd11Q1RNF8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd11Q1RNF8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd11Q1RNF8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd11Q1RNF8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd11Q1RNF8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd11Q1RNF8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms