Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim71Q1PSW8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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