Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cers3Q1A3B0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms