Protein–RNA interactions for Protein: Q149M0

Clec12b, C-type lectin domain family 12 member B, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec12bQ149M0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clec12bQ149M0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clec12bQ149M0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clec12bQ149M0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Clec12bQ149M0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Clec12bQ149M0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Clec12bQ149M0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clec12bQ149M0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clec12bQ149M0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clec12bQ149M0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms