Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf3ip1Q149C2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms