Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Perm1Q149B8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Perm1Q149B8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms