Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms