Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rundc1Q0VDN7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms