Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
StumQ0VBF8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms