Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntnap5bQ0V8T8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms