Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r181Q0P547 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms