Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc7a1Q09143 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms