Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Kcnma1Q08460 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms