Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms