Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms