Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmbpQ07456 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms