Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Siah1bQ06985 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms