Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrstQ06666 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms