Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf4Q06507 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms