Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc2Q05020 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms