Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms