Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox9Q04887 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox9Q04887 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms