Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox8Q04886 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms