Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Emx2Q04744 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Emx2Q04744 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms