Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smarcad1Q04692 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms