Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcr5Q04683 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms