Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd1Q04519 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smpd1Q04519 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms